Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHARPINQ9H0F6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHARPINQ9H0F6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms