Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM6Q9C030 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms