Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMES1Q9C002 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms