Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTNAP3Q9BZ76 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms