Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-5Q9BYS1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms