Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL4Q9BYD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms