Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A5Q9BY07 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms