Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD1Q9BXT4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms