Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRTQ9BXP5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRTQ9BXP5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms