Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms