Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSBP4Q9BWG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms