Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAIPQ9BWF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAIPQ9BWF2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAIPQ9BWF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAIPQ9BWF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAIPQ9BWF2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms