Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP58Q9BVL2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP58Q9BVL2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms