Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms