Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPON2Q9BUD6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms