Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA3Q9BTC8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA3Q9BTC8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA3Q9BTC8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms