Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT17Q9BSW7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT17Q9BSW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms