Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCGF1Q9BSM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCGF1Q9BSM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms