Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPPED1Q9BRF8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms