Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms