Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOXF2Q9BQY4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms