Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL2Q9BQD1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms