Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYSTQ99698 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms