Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGRRF1Q99675 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGRRF1Q99675 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGRRF1Q99675 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGRRF1Q99675 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1Q99675 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms