Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHP1Q99653 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP1Q99653 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms