Protein–RNA interactions for Protein: Q99593

TBX5, T-box transcription factor TBX5, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX5Q99593 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX5Q99593 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TBX5Q99593 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms