Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEBP4Q96S96 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEBP4Q96S96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms