Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED4Q96RK1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED4Q96RK1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms