Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DEPDC7Q96QD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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