Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LMTK3Q96Q04 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms