Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGAP1Q96PV0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms