Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms