Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP57Q96MR6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP57Q96MR6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms