Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD1Q96MG8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms