Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM227BQ96M60 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms