Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC17Q96LX7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC17Q96LX7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms