Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EP400Q96L91 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EP400Q96L91 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms