Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPGRIP1Q96KN7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms