Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAX2Q96IS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAX2Q96IS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAX2Q96IS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAX2Q96IS3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms