Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM19Q96E16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms