Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB39BQ96DA2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB39BQ96DA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB39BQ96DA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB39BQ96DA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB39BQ96DA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB39BQ96DA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39BQ96DA2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB39BQ96DA2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.9 ms