Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms