Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms