Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms