Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUNDC1Q96C34 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUNDC1Q96C34 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUNDC1Q96C34 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms