Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLUAP1Q96AJ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLUAP1Q96AJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms