Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TRIM52Q96A61 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms