Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms