Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TSR2Q969E8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TSR2Q969E8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR2Q969E8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TSR2Q969E8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TSR2Q969E8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms