Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF25Q93038 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25Q93038 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms